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学术前沿 | DNA甲基化可预测局限性前列腺癌术后复发风险

2017-03-31 来源:基准医疗

基准医疗CEO范建兵博士参与福瑞德哈金森肿瘤研究中心Janet L. Stanford教授主持的DNA甲基化在前列腺癌相关研究,临床大样本试验结果显示DNA甲基化在前列腺癌术后复发风险预测中的应用价值。


试验入组了来自该研究中心(Discovery cohort)的430个手术切除的前列腺癌肿瘤组织,采用Infinium® HumanMethylation450 BeadChip进行基因组范围的DNA甲基化模式检测转移灶则通过骨扫描,MRI,CT,组织活检等结果进行确认。结合AUC,partial AUC以及P值等统计学方法,挑选出可以预测转移致死和没有复发的病人的特异的DNA甲基化marker,作为Gleason分级的重要补充。


在转移致死和没有复发的前列腺癌患者(discovery cohort)中,共发现42个DNA 甲基化marker。其中8个在东弗吉尼亚医学院的validation cohort(n=80)中得到了验证(P <0.05) AUC (range: 0.66-0.75) or pAUC(range: 0.007-0.009)。这些甲基化的marker包括5个基因(ALKBH5, ATP11A, FHAD1, KLHL8, and PI15)的CpGs以及3个基因间区的CpGs。




当单独采用Gleason分级指数进行复发风险预测时,AUC为0.82。而当Gleason分级指数与CpGs联合进行分析时,AUC为0.86-0.89。





总体来说,该研究鉴定出了一组新的可用于预测前列腺癌患者术后复发的DNA 甲基化marker,并且能够显著提升Gleason分级指数用于预测转移致死患者的能力。让我们看到了DNA甲基化marker用于临床中的潜力。当然,还需要更多的临床研究去验证本文发现的这一组DNA 甲基化panel在前列腺癌以及其他癌种中的临床应用价值。



参考文献:

Zhao S, Geybels M S, Leonardson A, et al. Epigenome-Wide Tumor DNA Methylation Profiling Identifies Novel Prognostic Biomarkers of Metastatic-Lethal Progression in Men Diagnosed with Clinically Localized Prostate Cancer[J]. Clinical Cancer Research, 2017, 23(1): 311-319.

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