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两全其美 | 肿瘤诊断,原发病灶定位

2017-04-28 来源:基准医疗

导读:外周血中存在肿瘤细胞释放的特异性DNA片段,被称为ctDNA(circulating tumor DNA)。ctDNA携带与原发肿瘤一致的分子信息,能够真实的反映肿瘤的基因信息,是疾病诊断和组织溯源的理想检测指标。


加州大学洛杉矶分校(UCLA)的Jasmine Zhou教授认为:每种肿瘤都有其特异性的甲基化谱,因此通过检测ctDNA的甲基化模式,不仅能够发现肿瘤,明确肿瘤类型,还能够进行肿瘤原发灶定位。Zhou教授及其团队将其最新ctDNA甲基化在肿瘤诊断的研究成果发表在了《Genome Biology》上。


检测方法工作流程图



研究团队首先从TCGA肿瘤数据库中收集5种癌症(乳腺、结肠、肾脏、肝脏及肺)的组织DNA甲基化谱,结合血浆样本的甲基化研究文献,筛选出肺癌、肝癌及乳腺癌患者特异性ctDNA甲基化位点,以健康人群血浆中DNA甲基化为数据基础,建立肿瘤诊断模型,以期通过外周血检测,分析出受检者是肺癌、肝癌、乳腺癌患者或健康人群,如果有肿瘤特异的甲基化信号,分析其具体的肿瘤类型。


通过血浆样本建立诊断模型后,对630例血液样本(包括肝癌、肺癌、乳腺癌及健康人群)进行盲样验证,结果显示该诊断模型对肝癌患者及健康人群判断准确率高于80%,但肺癌患者中仅有56%,乳腺癌患者不足50%。研究中发现,肝癌患者血浆中ctDNA浓度远高于乳腺癌患者,这可能与不同组织细胞代谢活跃度相关。Zhou教授认为血液中ctDNA含量会影响检测结果准确度。


通过ctDNA甲基化检测,辅助肿瘤的诊断及病灶定位,或可成为肿瘤检测的新方向。



参考文献

Kang S, Li Q, Chen Q, et al. CancerLocator: non-invasive cancer diagnosis and tissue-of-origin prediction using methylation profiles of cell-free DNA[J]. Genome Biology, 2017, 18(1): 53.

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